Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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