Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms