Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NEDD8Q15843 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms