Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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