Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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