Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HDM1Q15032 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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