Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB39AQ14964 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms