Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB1Q14722 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB1Q14722 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms