Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VGLL4Q14135 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL4Q14135 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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