Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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