Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRQ13535 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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