Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCIRG1Q13488 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCIRG1Q13488 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms