Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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