Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM28Q13263 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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