Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX3Q13185 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX3Q13185 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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