Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RLFQ13129 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLFQ13129 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLFQ13129 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLFQ13129 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLFQ13129 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLFQ13129 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLFQ13129 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLFQ13129 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms