Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PRDM2Q13029 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRDM2Q13029 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
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