Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms