Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD47Q08722 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD47Q08722 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD47Q08722 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD47Q08722 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD47Q08722 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms