Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms