Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-1Q07627 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms