Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms