Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN11Q06124 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms