Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CD164Q04900 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CD164Q04900 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CD164Q04900 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CD164Q04900 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CD164Q04900 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CD164Q04900 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CD164Q04900 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CD164Q04900 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CD164Q04900 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CD164Q04900 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms