Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A11Q02978 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms