Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms