Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC025437.4-201ENST00000522975 681 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms