Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ID3Q02535 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms