Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPEQ02224 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms