Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A3Q01959 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A3Q01959 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms