Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms