Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTBN1Q01082 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms