Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD1P98174 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGD1P98174 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD1P98174 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms