Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP46P62068 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP46P62068 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP46P62068 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP46P62068 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP46P62068 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP46P62068 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP46P62068 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP46P62068 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP46P62068 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP46P62068 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP46P62068 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP46P62068 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP46P62068 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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