Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTBP60709 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTBP60709 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTBP60709 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTBP60709 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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