Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK1P57059 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK1P57059 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK1P57059 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIK1P57059 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIK1P57059 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIK1P57059 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIK1P57059 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK1P57059 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms