Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX9P55771 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms