Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA2D1P54289 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms