Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA3P52797 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms