Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRATP43155 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRATP43155 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRATP43155 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms