Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPOP42166 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMPOP42166 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMPOP42166 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPOP42166 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPOP42166 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPOP42166 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPOP42166 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPOP42166 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms