Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM3P40198 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms