Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms