Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTX2P32243 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX2P32243 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX2P32243 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX2P32243 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX2P32243 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTX2P32243 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX2P32243 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX2P32243 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms