Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms