Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD1P29536 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms