Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD34P28906 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD34P28906 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD34P28906 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD34P28906 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms