Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YY1P25490 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YY1P25490 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
YY1P25490 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YY1P25490 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YY1P25490 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YY1P25490 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms