Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B1P20020 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms