Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPGDP15428 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HPGDP15428 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HPGDP15428 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HPGDP15428 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HPGDP15428 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms